1、参与门槛不同：
面向个人的大额存单一般是20万元起存，企业起存金额是1000万元，大额存款一般5万元即可参与，门槛要低很多。
2、发行方式不同：
银行每年发行第一期大额存单之前都需要向央行报备计划，每年发行都有限额，而大额存款银行有充分的自主权。大额存单是按期限、按额度发行，不在发行期限内，储户可能买不到，而大额存款不存在发行期。
3、利率不同：
一般来说，大额存单利率的上浮比例是不超过同期基准利率的55%，而大额存款银行可根据自身的情况作出实时调整。相同期限大额存单利率要比大额存款的利率高。
4、产品期限不同：
大额存单一共有9个存期（1个月、3个月、6个月、9个月、1年、18个月、2年、3年、5年），而大额存款只有6个存期（3个月、6个月、1年、2年、3年、5年）。
5、流动性不同：
银行大额存单可提前支取、靠档计息，可转让、可质押贷款，甚至支持按月（季度）付息。而大额存款，一旦提前支取，只能按活期计息，流动性较差。
6、计息规则不同：
大额存单的计息方式不是单一的，有一次性到期还本付息、按月付息到期还本等，而大额存款的计息方式只有一次性到期还本付息方式。
大额存单部分提前支取或全部提前支取，一般靠档分段计息，即使提前支取利率也高于活期存款利率；而大额存款是定期计算规则，提前支取部分按照支取日挂牌活期利率计算利息。
总之，大额存单和大额存款本质上都属于定期存款，是定期存款的一种类型，与普通定期存款相比，投资起点要高，利率也要高。
